MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2145901075 · doi:10.1104/pp.106.088955

Extracellular <i>γ</i>-Aminobutyrate Mediates Communication between Plants and Other Organisms

2006· article· en· W2145901075 sur OpenAlexaff
Barry J. Shelp, Alan W. Bown, Denis Faure

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGABA and Rice Research
Établissements canadiensUniversity of GuelphBrock University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExtracellularBiologyAmino acidCell biologyBiochemistryChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plants exhibit mutually beneficial and antagonistic interactions with a variety of prokaryotic and eukaryotic organisms. We argue that these interactions are mediated in part by extracellular plant-derived γ-aminobutyrate (GABA). GABA is a ubiquitous four-carbon, nonprotein amino acid that is synthesized from Glu in a reaction catalyzed by the cytosolic enzyme Glu decarboxylase (GAD; Bown and Shelp, 1997; Shelp et al., 1999; Bouché and Fromm, 2004). It is noteworthy that plant GAD possesses a calmodulin (CaM)-binding domain that enables in vitro activity at pH 7.0 to 7.5 to be stimulated by the Ca2+/CaM complex. In contrast, activity at acidic pH values is unaffected by Ca2+/CaM and has a sharp pH optimum at 5.8. Subsequently, the GABA carbon is converted into succinic semialdehyde, and then to succinate, in reactions catalyzed by two mitochondrial enzymes, GABA transaminase and succinic semialdehyde dehydrogenase, respectively. In invertebrates (Sattelle, 1990) and vertebrates (Bormann, 2000), GABA is a potent inhibitory neurotransmitter. In plants, rapid GABA accumulation occurs in response to a variety of stresses (Bown and Shelp, 1997; Shelp et al., 1999; Kinnersley and Turano, 2000); however, the function(s) of that accumulation remains contentious. In many studies, accumulation results in the appearance of extracellular GABA, either in the apoplast or external medium (Secor and Schrader, 1985; Chung et al., 1992; Crawford et al., 1994; Solomon and Oliver, 2001). Extracellular GABA could result from exocytosis across the plasma membrane using a mechanism similar to that found in animal neurons (McIntire et al., 1997). In addition, wounding and associated disruption of cellular compartmentation release the acidic vacuolar contents to the cytosol, thereby activating GAD and stimulating GABA release from the wound to the external medium (Bown et al., 2006).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations126
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLANT PHYSIOLOGYMême sujetGABA and Rice ResearchTravaux en français237 207