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Enregistrement W2146001683 · doi:10.1074/jbc.m310502200

The Plasmodium falciparum PfGatp is an Endoplasmic Reticulum Membrane Protein Important for the Initial Step of Malarial Glycerolipid Synthesis

2004· article· en· W2146001683 sur OpenAlexfundno aff
Teresa Santiago, Rachel Zufferey, Rajendra S. Mehra, Rosalind Coleman, Choukri Ben Mamoun

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesU.S. ArmyMcMaster UniversityDalhousie UniversityUniversity of ConnecticutNational Institutes of HealthRobert E. Leet and Clara Guthrie Patterson Trust
Mots-clésEndoplasmic reticulumBiogenesisPlasmodium falciparumBiologyBiochemistryCell biologyPhospholipidSaccharomyces cerevisiaeYeastGeneMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During its 48-h asexual life cycle within human erythrocytes, Plasmodium falciparum grows to many times its own size and divides to produce 16-32 new parasites. This rapid multiplication requires active synthesis of new membranes and is fueled by phospholipid precursors and fatty acids that are scavenged from the human host. Plasmodium membrane biogenesis relies heavily on the expression of parasite enzymes that incorporate these precursors into phospholipids. However, little is known about the genes involved in membrane biogenesis or where this process takes place within the parasite. Here, we describe the analysis in P. falciparum of the first step of phospholipid biosynthesis that controls acylation of glycerol 3-phosphate (GPAT) at the sn-1 position. We show that this activity is of parasite origin and is specific for glycerol 3-phosphate substrate. We have identified the gene, PfGAT, encoding this activity in P. falciparum and reconstituted its codon composition for optimal expression in the yeast Saccharomyces cerevisiae. PfGAT complements the lethality of a yeast double mutant gat1Deltagat2Delta, lacking GPAT activity. Biochemical analysis revealed that PfGatp is a low affinity GPAT enzyme with a high specificity for C16:0 and C16:1 substrates. PfGatp is an integral membrane protein of the endoplasmic reticulum expressed throughout the intraerythrocytic life cycle of the parasite but induced mainly at the trophozoite stage. This study, which describes the first protozoan GPAT gene, reveals an important role for the endoplasmic reticulum in the initial step of Plasmodium membrane biogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,337

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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