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Enregistrement W2146020261 · doi:10.1186/1476-9255-9-4

Apoptosis inhibition or inflammation: the role of NAIP protein expression in Hodgkin and non-Hodgkin lymphomas compared to non-neoplastic lymph node

2012· article· en· W2146020261 sur OpenAlexaff
Safoura Mazrouei, Amin Ziaei, Amir Pouya Tanhaei, Kianoosh Keyhanian, Mahdad Esmaeili, Azar Baradaran, Mansoor Salehi

Notice bibliographique

RevueJournal of Inflammation · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesShahid Beheshti University of Medical SciencesMazandaran University of Medical SciencesIsfahan University of Medical SciencesFriedrich-Schiller-Universität Jena
Mots-clésMedicineInflammationApoptosisLymph nodeLymphomaCancer researchLymphPathologyImmunologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Inhibitors of Apoptosis (IAP) family play a critical role in apoptosis and inflammatory response. Neuronal Apoptosis Inhibitory Protein (NAIP), as a member of both IAPs and NLR families (NOD-Like Receptor), is a unique IAP harboring NOD (Nucleotide Oligomerization Domain) and LLR (Leucine Rich Repeat) motifs. Considering these motifs in NAIP, it has been suggested that the main function of NAIP is distinct from other members of IAPs. As a member of NLR, NAIP mediates the assembly of 'Inflammasome' for inflammatory caspase activation. Pathologic expression of NAIP has been reported not only in some infectious and inflammatory diseases but also in some malignancies. However, there is no report to elucidate NAIP expression in lymphomatic malignancies. METHODS: In this study, we examined NAIP protein expression in 101 Formalin-Fixed Paraffin-Embedded blocks including samples from 39 Hodgkin Lymphoma and 23 Non Hodgkin Lymphoma cases in comparison with 39 control samples (30 normal and 9 Reactive Lymphoid Hyperplasia (RLH) lymph nodes) using semi-quantitative immuno-flourecent Staining. RESULTS: NAIP expression was not statistically different in lymphoma samples neither in HL nor in NHL cases comparing to normal samples. However, we evaluated NAIP expression in normal and RLH lymph nodes. Surprisingly, we have found a statistically significant-difference between the NAIP expression in RLH (M.R of NAIP/GAPDH expression = 0.6365 ± 0.017) and normal lymph node samples (M.R of NAIP/GAPDH expression = 0.5882 ± 0.047) (P < 0.01). CONCLUSIONS: These findings show that the regulation of apoptosis could not be the main function of NAIP in the cell, so the pathologic expression of NAIP is not involved in lymphoma. But, we concluded that the over expression of NAIP has more effective role in the inflammatory response. Also, this study clarifies the NAIP expression level in lymphoma which is required for IAPs profiling in order to be used in potential translational applications of IAPs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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