A Role for DEAD Box 1 at DNA Double-Strand Breaks
Notice bibliographique
Résumé
DEAD box proteins are a family of putative RNA helicases associated with all aspects of cellular metabolism involving the modification of RNA secondary structure. DDX1 is a member of the DEAD box protein family that is overexpressed in a subset of retinoblastoma and neuroblastoma cell lines and tumors. DDX1 is found primarily in the nucleus, where it forms two to four large aggregates called DDX1 bodies. Here, we report a rapid redistribution of DDX1 in cells exposed to ionizing radiation, resulting in the formation of numerous foci that colocalize with gamma-H2AX and phosphorylated ATM foci at sites of DNA double-strand breaks (DSBs). The formation of DDX1 ionizing-radiation-induced foci (IRIF) is dependent on ATM, which was shown to phosphorylate DDX1 both in vitro and in vivo. The treatment of cells with RNase H prevented the formation of DDX1 IRIF, suggesting that DDX1 is recruited to sites of DNA damage containing RNA-DNA structures. We have shown that DDX1 has RNase activity toward single-stranded RNA, as well as ADP-dependent RNA-DNA- and RNA-RNA-unwinding activities. We propose that DDX1 plays an RNA clearance role at DSB sites, thereby facilitating the template-guided repair of transcriptionally active regions of the genome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».