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Enregistrement W2146084458

Understanding the etiology of obesity : a multi-faceted approach

2011· dissertation· en· W2146084458 sur OpenAlexaboutno aff
Jennifer Shea

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2011
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNutrition, Genetics, and Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésObesityBody mass indexEtiologyPopulationMedicineSingle-nucleotide polymorphismDiseaseAdipokineInternal medicineBioinformaticsGenome-wide association studyEndocrinologyGeneticsBiologyGenotypeEnvironmental healthInsulin resistanceGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Obesity, caused by an excessive accumulation of body fat due to a chronic energy surplus, is a serious public health concern with numerous comorbidities. It is a complex disease with many factors contributing to its manifestation; it is thought that obesity results from the action of multiple genes in combination with lifestyle and environmental factors. At the current time, only a fraction of the genes involved in obesity have been identified. The aims of this thesis were first, to characterize the obesity phenotype in the Newfoundland population and second, shed light on its genetic etiology. This goal was achieved using data from two different studies - the large scale, population-based CODING (Complex Diseases in the Newfoundland Population: Environment and Genetics) Study and an intervention-based, 7-day overfeeding study. -- We have shown that body mass index (BMI) misclassifies adiposity status in nearly one-third of individuals compared to the more accurate reference method, dual energy X-ray absorptiometry (DXA). Furthermore, we found that approximately half of obese subjects were metabolically healthy when using DXA criteria, which was significantly higher than previous reports using BMI. Among BMI-defined normal weight individuals, higher body fat percentage (%BF) determined using DXA was associated with a 3-fold increased risk of cardiometabolic disease. To further understand the genetic etiology, a candidate gene, genetic association approach was utilized. We identified two SNPs (rs10882280 and rs11187545) within RBP4, a newly discovered adipokine, that were associated with increased serum HDL cholesterol but no other obesity-related parameter. No significant associations were observed between genetic variation in another novel adipokine, NAMPT, and parameters of glucose and lipid metabolism, obesity, or systemic inflammation. We also sought to explore the response of lean and obese subjects to a 7-day hypercaloric diet. We found that RBP4 was not regulated by the overfeeding challenge but could serve as a predictor of insulin resistance in lean subjects. In addition, 45 novel obesity candidate genes have been identified that were regulated by the nutritional challenge; of these, six were differentially expressed between lean and obese and as such, represent the most promising targets for downstream work related to obesity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,030

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0060,002
Études des sciences et des technologies0,0020,005
Communication savante0,0070,007
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0020,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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