Lack of Association Between IRF5 Gene Polymorphisms and Biopsy-proven Giant Cell Arteritis
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: A novel association with a 100-kb region on chromosome 9 that contains the tumor necrosis factor receptor-associated factor 1 (TRAF1) and C5 genes has been observed in some autoimmune rheumatic diseases, in particular in rheumatoid arthritis. We analyzed the influence of 2 single-nucleotide polymorphisms (SNP) from the TRAF1/C5 region in susceptibility to giant cell arteritis (GCA). METHODS: We assessed 220 patients with biopsy-proven GCA and 410 matched controls. DNA from patients and controls was obtained from peripheral blood. Samples were genotyped for the rs10818488 and rs2900180 TRAF1/C5 gene polymorphisms by polymerase chain reaction, using a predesigned TaqMan allele discrimination assay. RESULTS: A genotyping rate of 95% was achieved in this series of GCA. No significant differences in the genotype distribution between GCA patients and controls were found for the 2 SNP. GCA patients exhibited a reduced frequency of TRAF1/C5 AA homozygosity (7.6%) compared to controls (12.7%) but the difference was only marginally significant (OR 0.58, 95% CI 0.30-1.11, p = 0.07). The frequency of minor allele T of TRAF1/C5 rs2900180 was also slightly reduced in patients (24.3%) compared to controls (27.8%) (p = 0.19). No significant differences were observed when patients were stratified according to the presence of specific clinical disease features. CONCLUSION: Our results showed no influence of rs10818488 and rs2900180 TRAF1/C5 gene polymorphisms in susceptibility to and clinical expression of GCA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».