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Enregistrement W2146240738 · doi:10.1093/glycob/cwm039

Enzymatic synthesis of cello-oligosaccharides by rice BGlu1 β-glucosidase glycosynthase mutants

2007· article· en· W2146240738 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGlycobiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesRoyal Golden Jubilee (RGJ) Ph.D. ProgrammeThailand Research FundMahidol University
Mots-clésChemistryGlycoside hydrolaseResidue (chemistry)StereochemistryGlycosylOligosaccharideAsparagineElectrospray ionizationHydrolaseMutantEnzymeBiochemistryMass spectrometryChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rice BGlu1 beta-glucosidase is a glycosyl hydrolase family 1 enzyme that acts as an exoglucanase on beta-(1,4)- and short beta-(1,3)-linked gluco-oligosaccharides. Mutations of BGlu1 beta-glucosidase at glutamate residue 414 of its natural precursor destroyed the enzyme's catalytic activity, but the enzyme could be rescued in the presence of the anionic nucleophiles such as formate and azide, which verifies that this residue is the catalytic nucleophile. The catalytic activities of three candidate mutants, E414G, E414S, and E414A, in the presence of the nucleophiles were compared. The E414G mutant had approximately 25- and 1400-fold higher catalytic efficiency than E414A and E414S, respectively. All three mutants could catalyze the synthesis of mixed length oligosaccharides by transglucosylation, when alpha-glucosyl fluoride was used as donor and pNP-cellobioside as acceptor. The E414G mutant gave the fastest transglucosylation rate, which was approximately 3- and 19-fold faster than that of E414S and E414A, respectively, and gave yields of up to 70-80% insoluble products with a donor-acceptor ratio of 5:1. (13)C-NMR, methylation analysis, and electrospray ionization-mass spectrometry showed that the insoluble products were beta-(1,4)-linked oligomers with a degree of polymerization of 5 to at least 11. The BGlu1 E414G glycosynthase was found to prefer longer chain length oligosaccharides that occupy at least three sugar residue-binding subsites as acceptors for productive transglucosylation. This is the first report of a beta-glucansynthase derived from an exoglycosidase that can produce long-chain cello-oligosaccharides, which likely reflects the extended oligosaccharide-binding site of rice BGlu1 beta-glucosidase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,713

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle