Small RNA Derived from the Virulence Modulating Region of the <i>Potato spindle tuber viroid</i> Silences <i>callose synthase</i> Genes of Tomato Plants
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Notice bibliographique
Résumé
The tomato (Solanum lycopersicum) callose synthase genes CalS11-like and CalS12-like encode proteins that are essential for the formation of callose, a major component of pollen mother cell walls; these enzymes also function in callose formation during pathogen infection. This article describes the targeting of these callose synthase mRNAs by a small RNA derived from the virulence modulating region of two Potato spindle tuber viroid variants. More specifically, viroid infection of tomato plants resulted in the suppression of the target mRNAs up to 1.5-fold, depending on the viroid variant used and the gene targeted. The targeting of these mRNAs by RNA silencing was validated by artificial microRNA experiments in a transient expression system and by RNA ligase-mediated rapid amplification of cDNA ends. Viroid mutants incapable of targeting callose synthase mRNAs failed to induce typical infection phenotypes, whereas a chimeric viroid obtained by swapping the virulence modulating regions of a mild and a severe variant of Potato spindle tuber viroid greatly affected the accumulation of viroids and the severity of disease symptoms. These data provide evidence of the silencing of multiple genes by a single small RNA derived from a viroid.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle