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Enregistrement W2146290818 · doi:10.1128/mbio.01178-15

An Alternative Terminal Step of the General Secretory Pathway in Staphylococcus aureus

2015· article· en· W2146290818 sur OpenAlexfundno aff
Arryn Craney, Melissa M. Dix, Ramkrishna Adhikary, Benjamin F. Cravatt, Floyd E. Romesberg

Notice bibliographique

RevuemBio · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésOperonSignal peptidaseBiologySecretionSecretory proteinSignal peptideSecretory pathwayDerepressionCell biologyBiochemistryGenePeptide sequenceCellEscherichia coliGene expressionPsychological repression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Type I signal peptidase (SPase) is essential for viability in wild-type bacteria because the terminal step of the bacterial general secretory pathway requires its proteolytic activity to release proteins from their membrane-bound N-terminal leader sequences after translocation across the cytoplasmic membrane. Here, we identify the Staphylococcus aureus operon ayrRABC (SA0337 to SA0340) and show that once released from repression by AyrR, the protein products AyrABC together confer resistance to the SPase inhibitor arylomycin M131 by providing an alternate and novel method of releasing translocated proteins. Thus, the derepression of ayrRABC allows cells to bypass the essentiality of SPase. We demonstrate that AyrABC functionally complements SPase by mediating the processing of the normally secreted proteins, albeit in some cases with reduced efficiency and either without cleavage or via cleavage at a site N-terminal to the canonical SPase cleavage site. Thus, ayrRABC encodes a secretion stress-inducible alternate terminal step of the general secretory pathway. IMPORTANCE : Addressing proteins for proper localization within or outside a cell in both eukaryotes and prokaryotes is often accomplished with intrinsic signals which mediate membrane translocation and which ultimately must be removed. The canonical enzyme responsible for the removal of translocation signals is bacterial type I signal peptidase (SPase), which functions at the terminal step of the general secretory pathway and is thus essential in wild-type bacteria. Here, we identify a four-gene operon in S. aureus that encodes an alternate terminal step of the general secretory pathway and thus makes SPase nonessential. The results have important implications for protein secretion in bacteria and potentially for protein trafficking in prokaryotes and eukaryotes in general.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,099
Score d'incertitude au seuil0,463

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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