Mapping of Genetic Determinants of Rubella Virus Associated with Growth in Joint Tissue
Notice bibliographique
Résumé
Rubella virus (RV) strains vary in their abilities to replicate and persist in cell cultures derived from human joint tissue (synovial cells [SC]), and this arthrotropism appears to be linked to their association with joint symptoms in vivo. In order to map the genetic determinants of arthrotropism, an infectious clone of the Cendehill vaccine strain of RV was constructed, as well as two chimeric clones containing cDNAs from both Cendehill and Therien (wild-type) strains. Replacement of the entire structural gene region of Therien in the infectious clone pROBO302 with the corresponding region of Cendehill did not affect growth in SC. A further observation that Cendehill bound equally well to SC and the permissive Vero cell line indicated that restriction was not at the level of receptor binding, a function of the envelope proteins. Mutations that affected growth in joint cells were mapped to two locations in the nonstructural gene region. The first of these (nucleotides 2803 and 6416) resulted in a 10-fold decrease in yield of progeny virus from SC. This region contained five mutations, at nucleotides 2829, 3060, 3164, and 3528 (near the carboxy terminus of P150 where the protease domain is located) and at nucleotide 4350 in p90. Further substitution of the sequence representing nucleotides 1 to 2803 to give a complete Cendehill infectious clone restricted growth in SC by a further 100-fold to less than 10 PFU/ml. This region contains three mutations, at nucleotides 34, 37, and 55, within the 5' stem-loop structure. In conclusion, the Cendehill-specific mutations believed to be determinants of joint cell growth are located in two regions, the 5' nontranslated region and in a sequence that encodes the carboxy-terminal region of p150 extending into the helicase domain of p90.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».