Performance of a Novel Molecular Method in the Diagnosis of Late-Onset Sepsis in Very Low Birth Weight Infants
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To compare the use of a generic molecular assay to 'standard' investigations used to assist the diagnosis of late onset bacterial sepsis in very low birth weight infants (VLBW, <1500 g). METHODS: VLBW infants, greater than 48 hours of age, who were clinically suspected to have sepsis were investigated using standard tests (full blood count, C-reactive protein (at presentation) and blood culture), in addition, blood was taken for a universal molecular assay (16S rRNA reverse transcriptase PCR) for comparison. Clinical data were recorded during the suspected infection episode. A validated sepsis score (NEO-KISS) was used to retrospectively determine the presence of sepsis (independent of blood culture). The performance of each of the tests were compared by sensitivity, specificity, positive/negative likihood ratios (+/-LR) and postive/negative predictive values (PPV/NPV). RESULTS: Sixty-five babies with suspected clinical sepsis were prospectively included. The performance indicators are presented with 95% confidence limits. For the detection of bacteria, blood culture had sensitivity of 0.57 (0.34-0.78), specificity of 0.45 (0.30-0.61); +LR of 1.05 (0.66-1.66) and-LR of 0.94 (0.52-1.7); PPV of 33.3 (18.56-50.97) and NPV of 68.97 (49.17-87.72). Serum CRP had sensitivity of 0.92 (0.64-1) and specificity of 0.36 (0.17-0.59); +LR of 1.45 (1-2.1) and-LR of 0.21 (0.03-1.5); PPV of 44.46 (26.6-66.6) and NPV of 88.9 (51.8-99.7). The universal molecular assay had sensitivity of 0.76 (0.53-0.92), specificity of 0.95 (0.85-0.99); +LR of 16.8 (4.2-66.3) and-LR of 0.25 (0.1-0.5); PPV of 88.9 (65.3-98.6) and NPV of 89.4 (76.9-96.5). CONCLUSIONS: In VLBW infants this universal molecular assay performed better in the diagnosis of late onset sepsis (LOS) than blood culture and CRP. Further development is required to explore and improve the performance of the assay in real-time diagnosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,013 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».