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Enregistrement W2146493095 · doi:10.1642/auk-13-237.1

A call for the preservation of images, recordings, and other data in association with avian genetic samples, and the introduction of a solution: OMBIRDS

2014· article· en· W2146493095 sur OpenAlexaff
Ildikò Szabó, Grant Hurley, Stephanie Cavaghan, Darren E. Irwin

Notice bibliographique

RevueThe Auk · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtocol (science)Task (project management)Computer scienceVariety (cybernetics)Data scienceData collectionGenetic dataOrnithologyAssociation (psychology)Information retrievalWorld Wide WebMultimediaBiologyArtificial intelligenceEcologyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Much current and historical research in ornithology employs catch-and-release methods, resulting in a variety of data and materials from birds for which whole-body specimens have not been collected. Often, a genetic specimen (e.g., blood or feathers) is collected along with “media specimens” such as images and/or sound recordings, providing a rich source of research material as well as an opportunity to use each type of specimen as a source of validation of the other. Despite the abundance of these datasets and their potential use in future research, the preservation of such data and associated materials is currently a task that each researcher must confront individually, which results in the loss of these research materials over time. To promote the long-term utility of information collected from the thousands of birds that are captured and released each year, we present a protocol and database template (OMBIRDS; the Online Museum of Bird Images, Recordings, and DNA Samples) for organizing and preserving images, recordings, and data associated with genetic samples. This protocol can be used by individual researchers and institutions to organize their own collections, and it also facilitates submission of records to international data repositories such as VertNet. By contributing OMBIRDS to the research community as a free database tool that can be downloaded and adapted by researchers and institutions, we hope to encourage the collection of media along with genetic samples and to facilitate the archiving of these materials for their use in future research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,521

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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Résumé présentoui

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