In vitro Proteolysis of Phosphoenolpyruvate Carboxylase from Developing Castor Oil Seeds by an Endogenous Thiol Endopeptidase
Notice bibliographique
Résumé
Two novel phosphoenolpyruvate carboxylase (PEPC) isoforms have been biochemically characterized from endosperm of developing castor oil seeds (COS). The association of a 107 kDa PEPC subunit (p107) with an immunologically unrelated bacterial PEPC-type 64 kDa polypeptide leads to marked physical and kinetic differences between the PEPC1 p107 homotetramer and PEPC2 p107/p64 heterooctamer. COS p107 is quite susceptible to limited proteolysis during PEPC purification. An endogenous asparaginyl endopeptidase appears to catalyze the in vitro cleavage of an approximately 120 amino acid polypeptide from the N-terminal end of p107, producing a truncated 98 kDa polypeptide (p98). Immunoblotting was used to estimate proteolytic activity by following the disappearance of p107 and concomitant appearance of p98 during incubation of clarified COS extracts at 4 degrees C. The in vitro proteolysis of p107 to p98 only occurred in the combined presence of 2 mM dithiothreitol and high salt concentrations (particularly SO(4) (2-) and PO(4) (2-) salts). Although p107-degrading activity was present throughout COS development, it was most pronounced in endosperm extracts from older beans. Several protease inhibitors, including two commercially available protease inhibitor cocktails, were tested for their ability to prevent p107 proteolysis. All of the inhibitors were ineffective except for 2,2'-dipyridyl disulfide (DPDS), a relatively inexpensive and underutilized active site inhibitor of plant thiol proteases. Asparaginyl endopeptidase activity of COS extracts was unaffected by 20% (NH(4))(2)SO(4) when determined in the presence or absence of 2 mM dithiothreitol using a spectrophotometric assay based upon the hydrolysis of benzoyl-L-Asn-p-nitroanilide. Thus, we propose that the combined presence of 2 mM dithiothreitol and 20% (NH(4))(2)SO(4) promotes a p107 conformational change that exposes the N-terminal region asparaginyl residue where p107 hydrolysis is believed to occur.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».