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Enregistrement W2146764908 · doi:10.1902/jop.2012.120477

Oral Neutrophils Display a Site‐Specific Phenotype Characterized by Expression of T‐Cell Receptors

2012· article· en· W2146764908 sur OpenAlexafffund
Flavia Lakschevitz, Guy M. Aboodi, Michael Glogauer

Notice bibliographique

RevueJournal of Periodontology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineDentistry
ThématiqueOral microbiology and periodontitis research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésInnate immune systemInflammationBiologyImmunologyImmune systemReceptorTranscriptomePeriodontitisNeutrophil extracellular trapsGene expressionMicroarray analysis techniquesPhenotypeCell biologyGeneMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Neutrophils, key cells of the innate immune system, were previously thought to be terminally differentiated cells, incapable of altering their gene expression after differentiation and maturation in the bone marrow. Only recently has it been shown that neutrophils perform rapid and complex changes in gene expression during inflammatory responses. Previous work by the authors has demonstrated differences in reactive oxygen species production between oral and peripheral blood neutrophils isolated from patients with chronic periodontitis, suggesting that oral neutrophils present with a unique oral phenotype. Understanding differences in the neutrophil transcriptome after transit from circulation into the site of inflammation will give new insights into how these innate immune cells function during inflammation. METHODS: Venous blood and oral rinse samples were obtained from five healthy participants. Blood neutrophils were isolated using a standard gradient method. Oral neutrophils were isolated through nylon mesh filters of different pore sizes (40 to 10 μm). RNA was purified from isolated neutrophils, and gene expression microarray analysis was completed. Results were confirmed by quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction and immunofluorescence microscopy. RESULTS: Oral neutrophil isolation, which is critical when analyzing gene expression with samples clear of epithelial cell contamination, was optimized. It was also demonstrated that oral neutrophils present with a significant increase in T-cell receptor expression compared with circulating neutrophils, suggesting a role for oral neutrophils in crosstalk between the innate and adaptive immune system in the mouth. CONCLUSION: To the best of the authors' knowledge, it is demonstrated for the first time that, compared with circulating neutrophils, oral neutrophils present a site-specific gene expression profile in healthy individuals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,590
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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