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Enregistrement W2146820909 · doi:10.1093/mutage/gen054

UV-inducible base excision repair of oxidative damaged DNA in human cells

2008· article· en· W2146820909 sur OpenAlexaff
Shaqil Kassam, Andrew J. Rainbow

Notice bibliographique

RevueMutagenesis · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteFred Hutchinson Cancer Research Center
Mots-clésMolecular biologyReporter geneCell cultureDNA damageDNA repairTransfectionDNAGene expressionBiologyBase excision repairGeneChemistryUltraviolet lightBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Methylene blue (MB) acts as a photosensitizer and after excitation by visible light (VL) produces reactive oxygen species that result in oxidatively damaged DNA. (MB + VL) produces predominantly 8-hydroxyguanine as well as other single base modifications in DNA that are repaired by base excision repair (BER). We have used a recombinant non-replicating human adenovirus, Ad5HCMVlacZ, which expresses the beta-galactosidase (beta-gal) reporter gene, to examine the role of the p53 tumor suppressor in constitutive and inducible BER of MB + VL-damaged DNA in human cells. Host cell reactivation (HCR) of beta-gal activity for MB + VL-treated Ad5HCMVlacZ was examined in normal human fibroblasts and several transformed and tumor cell lines with compromised p53 function using both non-treated cells and cells pretreated with ultraviolet light of 200-280 nm wavelength (UVC). Constitutive HCR of the MB + VL-treated reporter gene in untreated cells did not correlate with wild-type p53 expression levels, suggesting that factors other than p53 expression levels can influence constitutive BER of the reporter gene. UVC pre-treatment of the normal fibroblast strains resulted in an enhanced HCR of the MB + VL-treated reporter gene and a concomitant increase in the expression of p53, suggesting that p53 may be involved in UV-inducible BER in normal human fibroblasts. In contrast, p53 expression did not correlate with HCR values for the p53-compromised cells in UVC-pre-treated cells. In particular, the SKOV-3, LFS 087 and NF-E6 cells showed no up-regulation of p53 expression following UVC, and yet these cells showed significant enhancement of HCR following UVC pre-treatment. These results indicate that BER of MB + VL-damaged DNA is inducible in human cells by pre-UVC treatment and that the enhancement in BER may result from both p53-dependent and p53-independent mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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