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Enregistrement W2146853731 · doi:10.1128/jcm.40.1.68-74.2002

Emergence of Penicillin-Nonsusceptible <i>Streptococcus pneumoniae</i> Invasive Clones in Canada

2002· article· en· W2146853731 sur OpenAlexaffabout
David E. Greenberg, David P. Speert, Eshwar Mahenthiralingam, Deborah A. Henry, M E Campbell, David W. Scheifele

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPulsed-field gel electrophoresisPenicillinclone (Java method)SerotypeMicrobiologyBiologyStreptococcus pneumoniaeVirologyAntibiotic resistanceAntibioticsGenotypeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Distinctive international clones of penicillin-nonsusceptible and multidrug-resistant Streptococcus pneumoniae are increasingly being reported. We investigated the spread of these clones in Canada through an active surveillance that was carried out at 11 Canadian pediatric tertiary care centers from 1991 to 1998. All penicillin-nonsusceptible isolates were serotyped, tested for antibiotic susceptibility, and genotyped by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and random amplified polymorphic DNA (RAPD). Forty-five penicillin-nonsusceptible S. pneumoniae isolates were evaluated. Eleven serotype 9V isolates and six serotype 14 isolates displayed identical RAPD and PFGE fingerprint profiles. Twelve (70%) of these isolates were encountered in Quebec. The 9V/14 clone and the Spanish-French clone had similar PFGE fingerprint patterns. Eight isolates of serotype 23F and two isolates of serogroup 14 had the same fingerprint profiles and displayed resistance to three or more antibiotic drug classes. This clone was first detected in Calgary (Alberta) and in 1996 appeared simultaneously in various regions of Canada. This clone showed a PFGE fingerprint pattern similar to that of the Spanish-U.S. 23F clone. Our data show the emergence across Canada of two international clones of penicillin-nonsusceptible S. pneumoniae: (i) serotypes 9V and 14 related to the Spanish-French clone and (ii) the 23F Spanish-U.S. clone. The source of the first clone was in Quebec and the second international clone was probably originated from the United States. The exact reasons for the successful spread of these clones within Canada and their contribution to increased resistance to antibiotics have yet to be explored.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,134

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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