MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2146935558 · doi:10.1111/j.1744-7348.2004.tb00378.x

Proteome‐level changes in the roots of <i>Pisum sativum</i> in response to salinity

2004· article· en· W2146935558 sur OpenAlexafffund
Nat N. V. Kav, Sanjeeva Srivastava, Laksiri A. Goonewardene, S. F. Blade

Notice bibliographique

RevueAnnals of Applied Biology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMechanisms of cancer metastasis
Établissements canadiensAgriculture Food and Rural DevelopmentUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesUniversity of Alberta
Mots-clésSativumPisumBiologySalinityProteomeSuperoxide dismutaseProteomicsAbiotic stressPea proteinBotanyAbiotic componentBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary We initiated a proteomics‐based approach to identify root proteins affected by salinity in pea (Pisum sativum cv. Cutlass). Salinity stress was imposed either on 2‐wk old pea plants by watering with salt water over 6 wk or by germinating and growing pea seeds for 7 days in Petri dishes. Concentrations of NaCl above 75 mM had significant negative effects on growth and development of peas in both systems. Salinity‐induced root proteome‐level changes in pea were investigated by 2‐D electrophoresis of proteins from control, 75 and 150 mM NaCl‐treated plants and seedlings. The majority of the protein spots visualised showed reproducible abundance in root protein extracts from whole plants and seedlings. Of these proteins, 35 spots that exhibited significant changes in abundance due to NaCl treatment were selected for identification using ESI‐Q‐TOF MS/MS. The identities of these proteins, which include pathogenesis‐related (PR) 10 proteins, antioxidant enzymes such as superoxide dismutase (SOD) as well as nucleoside diphosphate kinase (NDPK) are presented, and the roles of some of them in mediating responses of pea to salinity are discussed. This is the first report of salinity‐induced changes in the root proteome of pea that suggests a potential role for PR10 proteins in salinity stress responses. Our findings also suggest the possible existence of a novel signal transduction pathway involving SOD, H 2 O 2 , NDPK and PR10 proteins with a potentially crucial role in abiotic stress responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,443

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations103
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAnnals of Applied BiologyMême sujetMechanisms of cancer metastasisTravaux en français237 207