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Enregistrement W2146969082 · doi:10.1042/bj20101840

The <i>DLK</i> gene is a transcriptional target of PPARγ

2011· article· en· W2146969082 sur OpenAlexaff
Jean-Philippe Couture, Richard Blouin

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesUniversité de GenèveAmerican College of Cardiology Foundation
Mots-clésGene knockdownChromatin immunoprecipitationBiologySmall hairpin RNACell biologyTranscriptional regulationAdipogenesisPeroxisome proliferator-activated receptorRegulation of gene expressionMolecular biologyGene expressionReceptorGeneBiochemistryPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DLK (dual leucine zipper-bearing kinase) is a key regulator of development, cell differentiation and apoptosis. Interestingly, recent studies have shown that DLK expression is up-regulated in 3T3-L1 cells induced to differentiate into adipocytes and that DLK knockdown impairs the expression of PPARγ (peroxisome-proliferator-activated receptor γ), a master regulator of adipogenesis. Because the PPARγ agonist rosiglitazone was found to increase DLK expression in 3T3-L1 cells, we hypothesized that PPARγ is required for the transcriptional activation of the DLK gene. To test this hypothesis, we first examined the effects of pharmacological inhibition or shRNA (small-hairpin RNA)-mediated depletion of PPARγ on DLK accumulation in 3T3-L1 cells undergoing differentiation. In addition to blocking adipocyte conversion of 3T3-L1 cells, inhibition of PPARγ suppressed DLK expression at both the mRNA and protein levels. Moreover, supporting a role for PPARγ in DLK regulation, two potential PPARγ-binding sites identified by bioinformatic tools at positions -611 and -767 upstream of the DLK gene transcriptional start site were shown by electrophoretic mobility-shift assay and chromatin immunoprecipitation to bind PPARγ and its essential heterodimer partner retinoid X receptor as differentiation proceeds. Collectively, these results show that DLK is a novel transcriptional target of PPARγ with functional PPARγ-binding sites in its promoter.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,404

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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