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Enregistrement W2146969082 · doi:10.1042/bj20101840

The <i>DLK</i> gene is a transcriptional target of PPARγ

2011· article· en· W2146969082 sur OpenAlexaff
Jean-Philippe Couture, Richard Blouin

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesUniversité de GenèveAmerican College of Cardiology Foundation
Mots-clésGene knockdownChromatin immunoprecipitationBiologySmall hairpin RNACell biologyTranscriptional regulationAdipogenesisPeroxisome proliferator-activated receptorRegulation of gene expressionMolecular biologyGene expressionReceptorGeneBiochemistryPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DLK (dual leucine zipper-bearing kinase) is a key regulator of development, cell differentiation and apoptosis. Interestingly, recent studies have shown that DLK expression is up-regulated in 3T3-L1 cells induced to differentiate into adipocytes and that DLK knockdown impairs the expression of PPARγ (peroxisome-proliferator-activated receptor γ), a master regulator of adipogenesis. Because the PPARγ agonist rosiglitazone was found to increase DLK expression in 3T3-L1 cells, we hypothesized that PPARγ is required for the transcriptional activation of the DLK gene. To test this hypothesis, we first examined the effects of pharmacological inhibition or shRNA (small-hairpin RNA)-mediated depletion of PPARγ on DLK accumulation in 3T3-L1 cells undergoing differentiation. In addition to blocking adipocyte conversion of 3T3-L1 cells, inhibition of PPARγ suppressed DLK expression at both the mRNA and protein levels. Moreover, supporting a role for PPARγ in DLK regulation, two potential PPARγ-binding sites identified by bioinformatic tools at positions -611 and -767 upstream of the DLK gene transcriptional start site were shown by electrophoretic mobility-shift assay and chromatin immunoprecipitation to bind PPARγ and its essential heterodimer partner retinoid X receptor as differentiation proceeds. Collectively, these results show that DLK is a novel transcriptional target of PPARγ with functional PPARγ-binding sites in its promoter.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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