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Enregistrement W2146997392 · doi:10.1039/b921248e

The effects of tryptophan and hydrophobicity on the structure and bioactivity of novel indolicidin derivatives with promising pharmaceutical potential

2010· article· en· W2146997392 sur OpenAlexafffund
Aaron P. Podorieszach, Heidi E. K. Huttunen‐Hennelly

Notice bibliographique

RevueOrganic & Biomolecular Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensThompson Rivers University
Organismes subventionnairesDirectorate for Biological SciencesThompson Rivers University
Mots-clésAntimicrobialChemistryCytotoxicityCandida albicansPeptideTryptophanAntibioticsAlanineMinimum inhibitory concentrationHemolysisAmino acidBiochemistryMicrobiologyIn vitroOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the current study, indolicidin, a known antimicrobial originally isolated from bovine neutrophils, was modified with respect to hydrophobicity and tryptophan content to maximize bioactivity, and minimize cytotoxicity. Since indolicidin contains five tryptophans (very hydrophobic) of its total 13 amino acids, alanine (mildly hydrophobic) was incrementally substituted in its place to generate five novel derivatives with decreasing hydrophobicity. Antimicrobial testing identified two active derivatives with minimum inhibitory concentrations in the 10(-9) g mL(-1) range against Candida albicans, as well as broad-spectrum activity against various other Gram-positive/negative pathogens in the 10(-3)-10(-6) g mL(-1) range. Cytotoxicity testing yielded minimum hemolytic concentrations of approximately 3 x 10(-3) g mL(-1) for both active derivatives, resulting in hemolytic indices of >1.3 x 10(6) (peptide Delta45) and 3.6 x 10(5) (peptide Delta5) (improvements of >33,000-fold and approximately 10,000-fold, respectively, compared to indolicidin). The potent antimicrobial activity and low cytotoxicity of these derivatives show promise as potential antibiotics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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