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Enregistrement W2147044529 · doi:10.1007/s10545-012-9492-z

Natural disease course and genotype‐phenotype correlations in Complex I deficiency caused by nuclear gene defects: what we learned from 130 cases

2012· review· en· W2147044529 sur OpenAlexaff
Saskia Koene, Richard J. Rodenburg, Marjo S. van der Knaap, Michèl A.A.P. Willemsen, Wolfgang Sperl, Vincent Laugel, Elsebet Østergaard, Mark A. Tarnopolsky, Miguel Á. Martín, Victoria Nesbitt, Janice M. Fletcher, Simon Edvardson, Vincent Procaccio, Abdelhamid Slama, Lambert P. W. J. den van Heuvel, J.A.M. Smeitink

Notice bibliographique

RevueJournal of Inherited Metabolic Disease · 2012
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypotoniaFailure to thrivePsychomotor retardationDiseaseLeukoencephalopathyMitochondrial diseaseAtrophyLeigh diseaseBiologyPathologyMedicineGeneticsPediatricsGeneMitochondrial DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondrial complex I is the largest multi-protein enzyme complex of the oxidative phosphorylation system. Seven subunits of this complex are encoded by the mitochondrial and the remainder by the nuclear genome. We review the natural disease course and signs and symptoms of 130 patients (four new cases and 126 from literature) with mutations in nuclear genes encoding structural complex I proteins or those involved in its assembly. Complex I deficiency caused by a nuclear gene defect is usually a non-dysmorphic syndrome, characterized by severe multi-system organ involvement and a poor prognosis. Age at presentation may vary, but is generally within the first year of life. The most prevalent symptoms include hypotonia, nystagmus, respiratory abnormalities, pyramidal signs, dystonia, psychomotor retardation or regression, failure to thrive, and feeding problems. Characteristic symptoms include brainstem involvement, optic atrophy and Leigh syndrome on MRI, either or not in combination with internal organ involvement and lactic acidemia. Virtually all children ultimately develop Leigh syndrome or leukoencephalopathy. Twenty-five percent of the patients died before the age of six months, more than half before the age of two and 75 % before the age of ten years. Some patients showed recovery of certain skills or are still alive in their thirties . No clinical, biochemical, or genetic parameters indicating longer survival were found. No clear genotype-phenotype correlations were observed, however defects in some genes seem to be associated with a better or poorer prognosis, cardiomyopathy, Leigh syndrome or brainstem lesions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations132
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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