Relationships of Campanian olive cultivars: comparative analysis of molecular and phenotypic data
Notice bibliographique
Résumé
Estimation of the genetic relatedness of traditional olive cultivars with genetic markers and phenotypic data enables progress in plant breeding, management of genetic resources, and protection of both breeders' rights and certified premium products. We used amplified fragment length polymorphisms (AFLPs), simple sequence repeats (SSRs), and quantitative and qualitative morphological traits, including characteristics recommended for variety registration, to study genetic diversity and relationships in the olive at different levels. The 14 varieties analyzed, which are used for the production of Protected Denomination of Origin extra-virgin olive oil, represent the most important cultivars in the Campania region of Italy and typify a regional diversity characteristic of traditional olive cultivation. The genetic distances obtained with the two DNA marker systems were significantly correlated, as were those obtained by quantitative and qualitative traits. A lower but significant correlation was also observed between distances based on molecular markers and quantitative traits, but qualitative traits, even if sampled in high numbers, failed to describe the pattern of molecular similarity. Our data imply that the type and the number of phenotypic traits scored can greatly influence the outcome of the analysis, and care should be taken when qualitative and quantitative data are combined. Furthermore, the data indicate that the two molecular marker systems are useful for investigating genetic relationships, but they may also be used to complement and assist the traditional registration of varieties. We propose that since the information provided by molecular and morphological marker systems in olive is different, they should serve different purposes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».