Somatic point mutations occurring early in development: a monozygotic twin study
Notice bibliographique
Résumé
The identification of somatic driver mutations in cancer has enabled therapeutic advances by identifying drug targets critical to disease causation. However, such genomic discoveries in oncology have not translated into advances for non-cancerous disease since point mutations in a single cell would be unlikely to cause non-malignant disease. An exception to this would occur if the mutation happened early enough in development to be present in a large percentage of a tissue's cellular population. We sought to identify the existence of somatic mutations occurring early in human development by ascertaining base-pair mutations present in one of a pair of monozygotic twins, but absent from the other and assessing evidence for mosaicism. To do so, we genome-wide genotyped 66 apparently healthy monozygotic adult twins at 506 786 high-quality single nucleotide polymorphisms (SNPs) in white blood cells. Discrepant SNPs were verified by Sanger sequencing and a selected subset was tested for mosaicism by targeted high-depth next-generation sequencing (20 000-fold coverage) as a surrogate marker of timing of the mutation. Two de novo somatic mutations were unequivocally confirmed to be present in white blood cells, resulting in a frequency of 1.2×10(-7) mutations per nucleotide. There was little evidence of mosaicism on high-depth next-generation sequencing, suggesting that these mutations occurred early in embryonic development. These findings provide direct evidence that early somatic point mutations do occur and can lead to differences in genomes between otherwise identical twins, suggesting a considerable burden of somatic mutations among the trillions of mitoses that occur over the human lifespan.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».