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Enregistrement W2147170741 · doi:10.1371/journal.pone.0089997

RNF8-Independent Lys63 Poly-Ubiquitylation Prevents Genomic Instability in Response to Replication-Associated DNA Damage

2014· article· en· W2147170741 sur OpenAlexafffund
Chantal H.M.A. Ramaekers, Twan van den Beucken, Robert G. Bristow, Roland K. Chiu, Daniel Durocher, Bradly G. Wouters

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesTransnationale Universiteit LimburgKWF KankerbestrijdingTerry Fox Research InstituteOntario Institute for Cancer ResearchAstraZeneca
Mots-clésUbiquitinGenome instabilityDNA damageDNA repairBiologyGene knockdownDNA replicationCell biologyDNAReplication protein AMolecular biologyDNA-binding proteinGeneticsCell cultureGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cellular response to DNA double strand breaks (DSBs) involves the ordered assembly of repair proteins at or near sites of damage. This process is mediated through post-translational protein modifications that include both phosphorylation and ubiquitylation. Recent data have demonstrated that recruitment of the repair proteins BRCA1, 53BP1, and RAD18 to ionizing irradiation (IR) induced DSBs is dependent on formation of non-canonical K63-linked polyubiquitin chains by the RNF8 and RNF168 ubiquitin ligases. Here we report a novel role for K63-ubiquitylation in response to replication-associated DSBs that contributes to both cell survival and maintenance of genome stability. Suppression of K63-ubiquitylation markedly increases large-scale mutations and chromosomal aberrations in response to endogenous or exogenous replication-associated DSBs. These effects are associated with an S-phase specific defect in DNA repair as revealed by an increase in residual 53BP1 foci. Use of both knockdown and knockout cell lines indicates that unlike the case for IR-induced DSBs, the requirement for K63-ubiquitylation for the repair of replication associated DSBs was found to be RNF8-independent. Our findings reveal the existence of a novel K63-ubiquitylation dependent repair pathway that contributes to the maintenance of genome integrity in response to replication-associated DSBs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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