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Enregistrement W2147214515 · doi:10.1002/xrs.2455

The use of X‐ray interaction data to differentiate malignant from normal breast tissue at surgical margins and biopsy analysis

2013· article· en· W2147214515 sur OpenAlexaff
M.J. Farquharson, Alia Al‐Ebraheem, Sylvie D. Cornacchi, Gabriela Gohla, Peter Lovrics

Notice bibliographique

RevueX-Ray Spectrometry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMedical Imaging Techniques and Applications
Établissements canadiensSt. Joseph’s Healthcare HamiltonMcMaster University
Organismes subventionnairesEuropean Commission
Mots-clésBiopsyMedicineBreast tissueSurgical marginRadiologyPathologyBreast cancerSurgeryCancerInternal medicineResection

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

X‐ray interaction data, including measuring bio‐metal levels and scattering characteristics, are being shown to be a possible discriminating variable in the classification of human tissues. However, a major concern when using X‐ray interaction data in breast cancer material is that the samples are rarely 100% tumour because of the invasive nature of the disease. The work reported here includes a methodology to help overcome this limitation as the experimental protocol includes mapping the data to histological analysis of the measured samples. This work has shown how important it is to relate the measured X‐ray parameters to the histology of the samples, particularly the clinical information that describes the percentage of tumour within each sample. Levels of K, Ca, Zn, Fe, Cu, Br and Rb were evaluated using X‐ray fluorescence and compared between tumour breast tissue and normal surrounding breast tissue. The coherent scattering properties of each sample were also examined using an angular dispersive X‐ray diffraction technique. Multivariate modelling using soft independent modelling of class analogy was used to classify samples kept out of the modelling procedure. A significant increase ( p < 0.01) in the levels of Rb, Zn and K was found in the tumour samples. The levels of these elements show a correlation with the percentage of tumour reported to be present in a given sample. The results of classifying unknown tissue samples are presented using two‐class and three‐class models that help to reveal the importance of sample histology in studies involving breast cancers. Copyright © 2013 John Wiley & Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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