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Enregistrement W2147225705 · doi:10.1111/j.1600-0609.2009.01344.x

The prolyl‐hydroxylase EGLN3 and not EGLN1 is inactivated by methylation in plasma cell neoplasia

2009· article· en· W2147225705 sur OpenAlexaff
Eleftheria Hatzimichael, Aggeliki Dasoula, Reshma Shah, Nelofer Syed, Alexandra Papoudou‐Bai, Helen M. Coley, George Dranitsaris, Konstantinos L. Bourantas, Justin Stebbing, Tim Crook

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal Of Haematology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesGenesis Pharma
Mots-clésPlasma cellPlasma cell leukemiaMonoclonal gammopathy of undetermined significanceCancer researchMultiple myelomaMethylationBiologyPlasmacytomaEpigeneticsMolecular biologyImmunologyMonoclonalBiochemistryAntibodyMonoclonal antibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

EGLN1 and EGLN3 are members of the egg-laying-defective 9 (EglN) prolyl-hydroxylases which during normoxia catalyse hydroxylation of the hypoxia-inducible factor (HIF)-1alpha, thereby promoting its ubiquitination by a complex containing the von Hippel-Lindau (VHL) tumour suppressor. EGLN3 also has pro-apoptotic activity in some cell types. Analyses of a well-characterised series of cases of plasma cell dyscrasias, including multiple myeloma (MM), Waldenström's macroglobulinaemia (WM) and monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS) surprisingly demonstrated that the CpG island of EGLN3, and not EGLN1, is frequently methylated in these disorders. Multiple myeloma patients with a methylated EGLN3 promoter showed trends towards an increased risk of death, bone lytic lesions, anaemia, advanced stage of disease and the presence of extramedullary disease. Those individuals with methylation in the EGLN3 CpG island also had significantly lower albumin levels. These data suggest that the prolyl-hydroxylases may be a novel class of potential tumour suppressors in plasma cell neoplasia that warrant further investigation with regard to their potential utility as biomarkers. Moreover, we observed that EGLN3 is also methylated at high frequency in B-cell lymphoma subtypes, implying that loss of EGLN3 is an important epigenetic event not only in plasma cell neoplasias but also in B-cell neoplasias.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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