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Enregistrement W2147234591 · doi:10.1074/jbc.m806797200

Delayed Chain Termination Protects the Anti-hepatitis B Virus Drug Entecavir from Excision by HIV-1 Reverse Transcriptase

2008· article· en· W2147234591 sur OpenAlexafffund
Egor P. Tchesnokov, Aleksandr Obikhod, Raymond F. Schinazi, Matthias Götte

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésEntecavirReverse transcriptaseVirologyHepatitis B virusHuman immunodeficiency virus (HIV)Reverse-transcriptase inhibitorMedicineHepatitis BVirusLamivudineBiologyViral diseasePolymerase chain reactionSidaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Entecavir (ETV) is a potent antiviral nucleoside analogue that is used to treat hepatitis B virus (HBV) infection. Recent clinical studies have demonstrated that ETV is also active against the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1). Unlike all approved nucleoside analogue reverse transcriptase RT) inhibitors (NRTIs), ETV contains a 3'-hydroxyl group that allows further nucleotide incorporation events to occur. Thus, the mechanism of inhibition probably differs from classic chain termination. Here, we show that the incorporated ETV-monophosphate (MP) can interfere with three distinct stages of DNA synthesis. First, incorporation of the next nucleotide at position n + 1 following ETV-MP is compromised, although DNA synthesis eventually continues. Second, strong pausing at position n + 3 suggests a long range effect, referred to as "delayed chain-termination." Third, the incorporated ETV-MP can also act as a "base pair confounder" during synthesis of the second DNA strand, when the RT enzyme needs to pass the inhibitor in the template. Enzyme kinetics revealed that delayed chain termination is the dominant mechanism of action. High resolution foot-printing experiments suggest that the incorporated ETV-MP "repels" the 3'-end of the primer from the active site of HIV-1 RT, which, in turn, diminishes incorporation of the natural nucleotide substrate at position n + 4. Most importantly, delayed chain termination protects ETV-MP from phosphorolytic excision, which represents a major resistance mechanism for approved NRTIs. Collectively, these findings provide a rationale and important tools for the development of novel, more potent delayed chain terminators as anti-HIV agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,057
Score d'incertitude au seuil0,461

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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