Two Chromosome 9p21 Haplotype Blocks Distinguish Between Coronary Artery Disease and Myocardial Infarction Risk
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Variants at the 9p21 locus associate with the risk of coronary artery disease (CAD) or myocardial infarction (MI). However, atherosclerotic plaque deposition is distinct from MI (plaque rupture and thrombosis), and recent studies showed no association between these variants and MI in patients with preexisting CAD. We performed haplotype analysis at the 9p21 locus to test whether haplotypes at distinct linkage disequilibrium blocks predict these phenotypes. METHODS AND RESULTS: Using 24 single-nucleotide polymorphisms genotyped in white patients without diabetes mellitus, we reconstructed haplotypes at the 9p21 locus. Patients with angiograhic CAD/MI had ≥1 epicardial stenosis >50% (n=2352), whereas controls were asymptomatic and over the age of 60 years (n=2116). For CAD patients, regression models examined the association of haplotypes with initial age of symptomatic CAD, number of diseased vessels, and history of MI. In the case-control study, only haplotypes at 1 block tagged by rs1333049 associated with CAD more so than MI. These haplotypes also associated with early onset of CAD (β=-0.13; P=1.37×10(-4)) and disease severity (β=0.1823; P=0.006) but not with prevalent MI among patients with CAD. In contrast, haplotypes at another block tagged by rs518394 associated with prevalent MI (β=0.239; P=2.05×10(-4)), but remarkably these are inversely associated with disease severity (β=-0.196; P=0.003). This MI association was replicated in the Cleveland Clinic GeneBank premature CAD cohort (n=1385; β=0.207; P=0.019). CONCLUSIONS: Variants/haplotypes at 2 blocks are distinguished at 9p21; those at 1 block predispose to atherosclerosis, whereas those at the other predispose to MI among patients with preexisting CAD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».