MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2147274538 · doi:10.1158/1940-6207.capr-11-0519

Microsatellite Instability and DNA Mismatch Repair Protein Deficiency in Lynch Syndrome Colorectal Polyps

2012· article· en· W2147274538 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCancer Prevention Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésMicrosatellite instabilityPMS2Lynch syndromeMLH1MSH2MSH6Familial adenomatous polyposisHyperplastic PolypInternal medicineDNA mismatch repairGermline mutationGastroenterologyColorectal cancerAdenomatous polyposis coliMedicineColorectal adenomaBiologyMutationCancerGeneticsMicrosatelliteColonoscopyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Colorectal cancers associated with Lynch syndrome are characterized by deficient DNA mismatch repair (MMR) function. Our aim was to evaluate the prevalence of microsatellite instability (MSI) and loss of MMR protein expression in Lynch syndrome-associated polyps. Sixty-two colorectal polyps--37 adenomatous polyps, 23 hyperplastic polyps, and 2 sessile serrated polyps (SSP)--from 34 subjects with germline MMR gene mutations were tested for MSI using a single pentaplex PCR for five mononucleotide repeat microsatellite markers, and also for expression of MLH1, MSH2, MSH6, and PMS2 proteins by immunohistochemistry. High-level MSI (MSI-H) was seen in 15 of 37 (41%) adenomatous polyps, one of 23 (4%) hyperplastic polyps, and one of two (50%) SSPs. Loss of MMR protein expression was seen in 18 of 36 (50%) adenomatous polyps, zero of 21 hyperplastic polyps, and zero of two SSPs. Adenomatous polyps 8 mm or larger in size were significantly more likely to show MSI-H [OR, 9.98; 95% confidence interval (CI), 1.52-65.65; P = 0.02] and deficient MMR protein expression (OR, 3.17; 95% CI, 1.20-8.37; P = 0.02) compared with those less than 8 mm in size. All (six of six) adenomatous polyps 10 mm or larger in size showed both MSI-H and loss of MMR protein expression by immunohistochemistry. Our finding that the prevalence of MMR deficiency increases with the size of adenomatous polyps suggests that loss of MMR function is a late event in Lynch syndrome-associated colorectal neoplasia. Although testing large adenomatous polyps may be of value in the diagnostic evaluation of patients with suspected Lynch syndrome, the absence of an MMR-deficient phenotype in an adenoma cannot be considered as a strong evidence against Lynch syndrome, as it is with colorectal carcinomas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,218
Score d'incertitude au seuil0,880

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,395
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle