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Enregistrement W2147281359 · doi:10.1139/g10-001

Mapping of quantitative trait loci for high level of self-incompatibility in<i>Brassica rapa</i>L.

2010· article· en· W2147281359 sur OpenAlexaffvenue
Katsunori Hatakeyama, Atsushi Horisaki, Satoshi Niikura, Yoshihiro Narusaka, Hiroshi Abe, Hitoshi Yoshiaki, Masahiko Ishida, Hiroyuki Fukuoka, Satoru Matsumoto

Notice bibliographique

RevueGenome · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of Science
Mots-clésQuantitative trait locusBiologyBrassica rapaBrassicaIndelGeneticsInbred strainPopulationGenetic linkageGeneBotanySingle-nucleotide polymorphismGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The level of self-incompatibility (SI) is important to the purity of F1 seeds produced using the SI system of Brassica vegetables. To analyze the genetic basis of the level of SI, we generated an F2 population derived from a cross between a turnip inbred line showing a high level of SI and a Chinese cabbage inbred line showing a low level, and evaluated the level of SI under insect pollination in two years. We constructed a detailed linkage map of Brassica rapa from the F2 progeny, consisting of SSR, SNP, indel, and CAPS loci segregating into 10 linkage groups covering approximately 700 cM. Five quantitative trait loci (QTL) for high-level SI were identified. The phenotypic variation explained by the QTL ranged between 7.2% and 23.8%. Two QTL were detected in both years. Mapping of SI-related genes revealed that these QTL were co-localized with SLG on R07 and MLPK on R03. This is the first report of QTL for high-level SI evaluated under insect pollination in a Brassica vegetable. Our results could be useful for the marker-assisted selection of parental lines with a stable SI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,230
Score d'incertitude au seuil0,420

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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