A Quantitative Trait Locus for Body Fat on Chromosome 1q43 in French Canadians: Linkage and Association Studies
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To explore a quantitative trait locus (QTL) on human chromosome 1q affecting BMI, adiposity, and fat-free mass phenotypes in the Quebec Family Study cohort. RESEARCH METHODS AND PROCEDURES: Non-parametric sibpair and variance component linkage analyses and family-based association studies were performed with a dense set of chromosome 1q43 microsatellites and single-nucleotide polymorphism markers in 885 adult individuals. RESULTS: Linkage was observed between marker D1S184 and BMI (p = 0.0004) and with body fat mass or percentage body fat (p < or = 0.0003), but no linkage was detected with fat-free mass. Furthermore, significant linkages (p < 0.0001) were achieved with subsamples of sibpairs at both ends of phenotype distributions. Association studies with quantitative transmission disequilibrium tests refined the linkage to a region overlapping the regulator of G-protein signaling 7 (RGS7) gene and extending to immediate upstream gene loci. DISCUSSION: The present study indicates that the QTL on chromosome 1q43 specifically affects total adiposity and provides a genetic mapping framework for the dissection of this adiposity locus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».