MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2147310504 · doi:10.1161/01.hyp.0000192024.72367.c3

Epistasis, Not Numbers, Regulates Functions of Clustered Dahl Rat Quantitative Trait Loci Applicable to Human Hypertension

2005· article· en· W2147310504 sur OpenAlexafffund
Sophie Charron, Chenda Duong, Annie Ménard, Julie Roy, Vasiliki Eliopoulos, Raphaëlle Lambert, Alan Y. Deng

Notice bibliographique

RevueHypertension · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensHôtel-Dieu de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésQuantitative trait locusCongenicEpistasisBiologyGeneticsGeneChromosomeFamily-based QTL mappingCandidate geneGene mapping

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Quantitative trait loci (QTLs) for blood pressure (BP) were found on chromosome 10 of Dahl salt-sensitive rats and are potentially important to human essential hypertension. But their identities and how they influence BP together were not known. Presently, we first fine mapped existing QTLs, C10QTL1, C10QTL2, and C10QTL3, by constructing congenic strains. In the process, a new QTL, C10QTL4, was identified. Because the intervals harboring C10QTL1 and C10QTL4 contain a maximum of 16 and 10 possible genes, respectively, a limited number of specific gene targets has been identified to be QTLs residing in human homologous regions on chromosome 17. Moreover, because none of these candidates encodes a gene known to influence BP, the 2 QTLs will represent novel genes for BP regulations. Second, we used congenic strains with QTL combinations to analyze the interactions between the QTLs. Consequently, a double combination of C10QTL4 and C10QTL1 possessed the same BP as each of the 2 QTLs alone. BP of a triple combination of C10QTL4, C10QTL1, and C10QTL3 was not different from BP of the C10QTL4 and C10QTL1 double combination. These results demonstrate that C10QTL4, C10QTL1, and C10QTL3 are epistatic to one another in their BP effects. In contrast, when adding C10QTL2 into the triple formation of the 3 QTLs above to create a quadruple QTL combination, BP increased proportionately, indicating that C10QTL2 acts independently of C10QTL4, C10QTL1, and C10QTL3. The epistatic and additive interactions uncovered in the animal model will help elucidate similar interactions playing a role in human essential hypertension.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,289
Score d'incertitude au seuil0,647

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHypertensionMême sujetGenetic Mapping and Diversity in Plants and AnimalsTravaux en français237 207