Alu elements in human growth hormone receptor gene 5' untranslated region exons
Notice bibliographique
Résumé
The human growth hormone receptor (hGHR) is encoded by exons 2-10 of the hGHR gene on chromosome 5p13.1-p12. There are several different 5' untranslated region (5'UTR) variants of hGHR mRNA (V1-V9) that all encode the same protein. We have recently mapped the V1-V9 5'UTR sequences within 40 kb of the 5' flanking region of the hGHR gene. Seven of the exons are clustered within two small modules, module A (V2-V9-V3) and module B (V7-V1-V4-V8), approximately 38 kb and approximately 18 kb respectively upstream of exon 2 of the coding region; V6 lies midway between the two modules and V5 is adjacent to exon 2. We now report the existence of two subvariant V3 exons, one upstream of module A (exon V3b) and one midway between module B and exon 2 (exon V3a/b). Both have sequences homologous to Alu elements. In addition, we determined the alternative splicing mechanisms that produce three different mRNAs from these exons: V3c (from the V3 exon in module A) or V3a and V3b (from a combination of exon V3 and the Alu-containing V3 subvariant exons). hGHR expression is under developmental- and tissue-specific regulation: module A-derived mRNAs are widely expressed in human tissues, while module B-derived mRNAs are only detectable in postnatal liver. Expression of the variant V3 mRNAs is similar to those from module A, being produced ubiquitously in human fetal and postnatal tissues, with V3c always the major variant detected. The Alu-containing mRNAs (V3a and V3b) are also detectable in baboon and rhesus tissues, in accordance with the finding of Alu elements throughout the primate genome. In summary, we have mapped the relative locations of two new 5'UTR exons within the 5' flanking region of the hGHR gene and described the derivation and expression patterns for two variant hGHR mRNAs from these primate-specific exons. The introduction of Alu elements has contributed to the evolution of the primate GHR gene as a highly complex transcriptional unit.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».