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Enregistrement W2147525469 · doi:10.1111/j.2041-210x.2011.00171.x

Cascade multivariate regression tree: a novel approach for modelling nested explanatory sets

2012· article· en· W2147525469 sur OpenAlexafffund
Marie‐Hélène Ouellette, Pierre Legendre, Daniel Borcard

Notice bibliographique

RevueMethods in Ecology and Evolution · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensUniversité de MontréalGDG EnvironnementUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésExplanatory powerMultivariate statisticsMarginal modelRegression analysisRegression diagnosticSet (abstract data type)MathematicsLinear regressionEconometricsStatisticsLinear modelBayesian multivariate linear regressionComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary 1. Ecological data analysis frequently calls for the assessment of the relationship between species composition and a set of explanatory variables of interest. The assessment may have to be pursued while taking into account the influence of another set of explanatory variables. The hypothetical nature and structure of the influence of an explanatory set on the effect of a distinct explanatory set guides the proper choice of modelling methodology for a combined explanatory assessment. 2. Here, we describe a framework where the relationship between the response data and a main set of explanatory variables is not linear. It may, for example, take the form of abrupt changes in the response following thresholds of the explanatory variables, or any other nonlinearizable relationship. The influence of a second set of explanatory variables is determined a posteriori , after the influence of the main explanatory set has been taken into account. This is useful when one of the sets is thought to have an effect that varies as a function of the other. 3. To achieve this type of assessment, we propose a cascade of multivariate regression trees (CMRT). We decompose the total dispersion of a response matrix between two explanatory data sets in a nested manner. By handling each leaf (group) resulting from the first‐level multivariate regression tree (MRT) analysis as separate independent data sets in following analyses, we can separate the explanatory power of the first partition from those of the subordinate partitions computed using a second explanatory set. A preliminary biological hypothesis will guide the choice of which set of explanatory variables should be used to compute the main partition. The method could be extended to more than two explanatory data sets whose effects on the response data are hierarchical. 4. Cascade of multivariate regression trees allows the users to impose a nested structure to their causal hypotheses in MRT analysis. To illustrate this new procedure, we use the well‐known and readily available Doubs fish and oribatid mite data sets and provide the necessary R functions in a package available on CRAN ( http://cran.r‐project.org ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,325
Score d'incertitude au seuil0,361

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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