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Enregistrement W2147526106 · doi:10.1128/jb.00779-13

Pasteurella multocida Heddleston Serovar 3 and 4 Strains Share a Common Lipopolysaccharide Biosynthesis Locus but Display both Inter- and Intrastrain Lipopolysaccharide Heterogeneity

2013· article· en· W2147526106 sur OpenAlexaff
Marina Harper, Frank St. Michael, Marietta John, Evgeny Vinogradov, Lieke van Dorsten, Jason A. Steen, Conny Turni, P. J. Blackall, Ben Adler, Andrew D. Cox, John D. Boyce

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPasteurella multocidaBacterial outer membraneLipopolysaccharideMicrobiologyLocus (genetics)VirulencePasteurellosisGeneticsGlycosyltransferaseSerotypeGeneFowl choleraBacteriaEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pasteurella multocida is a Gram-negative multispecies pathogen and the causative agent of fowl cholera, a serious disease of poultry which can present in both acute and chronic forms. The major outer membrane component lipopolysaccharide (LPS) is both an important virulence factor and a major immunogen. Our previous studies determined the LPS structures expressed by different P. multocida strains and revealed that a number of strains belonging to different serovars contain the same LPS biosynthesis locus but express different LPS structures due to mutations within glycosyltransferase genes. In this study, we report the full LPS structure of the serovar 4 type strain, P1662, and reveal that it shares the same LPS outer core biosynthesis locus, L3, with the serovar 3 strains P1059 and Pm70. Using directed mutagenesis, the role of each glycosyltransferase gene in LPS outer core assembly was determined. LPS structural analysis of 23 Australian field isolates that contain the L3 locus revealed that at least six different LPS outer core structures can be produced as a result of mutations within the LPS glycosyltransferase genes. Moreover, some field isolates produce multiple but related LPS glycoforms simultaneously, and three LPS outer core structures are remarkably similar to the globo series of vertebrate glycosphingolipids. Our in-depth analysis showing the genetics and full range of P. multocida lipopolysaccharide structures will facilitate the improvement of typing systems and the prediction of the protective efficacy of vaccines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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