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Enregistrement W2147626981 · doi:10.1002/chem.201003535

Probing the Role of the Linker in Ferrocene–ATP Conjugates: Monitoring Protein Kinase Catalyzed Phosphorylations Electrochemically

2011· article· en· W2147626981 sur OpenAlexafffund
Sanela Martić, Mahmoud Labib, Daniel J. Freeman, Heinz‐Bernhard Kraatz

Notice bibliographique

RevueChemistry - A European Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and Innovation
Mots-clésChemistryConjugateFerroceneLinkerCyclic voltammetryAlkylSteric effectsElectrochemistryStereochemistryCombinatorial chemistryOrganic chemistryPhysical chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The synthesis and electrochemical properties of ferrocene conjugates are presented for the purpose of investigating adenosine 5'-[γ-ferrocenoylalkyl] triphosphate (1 a-4 a, ferrocene (Fc)-ATP) as co-substrates for phosphorylation reactions. Compounds 1 a-4 a were synthesized, purified by HPLC, and characterized by NMR spectroscopy and mass spectrometry. In solution, all Fc-ATP bioconjugates exhibit a reversible one-electron redox process with a half-wave potential (E(1/2)) in the 390-430 mV range, peak separations (ΔE(p)) in the 40-70 mV range, and the peak current ratio (i(pa)/i(pc)) near unity. The peptide-modified surface Glu-Gly-Ile-Tyr-Asp-Val-Pro was used to study the sarcoma-related protein (Src) kinase activity by employing the Fc-ATP bioconjugates as co-substrates. Subsequent kinase-catalyzed transfer of the γ-Fc-phosphate group to the tyrosine residues of the surface-bound peptides was characterized by a formal potential (E°) ≈390 mV (vs. Ag/AgCl). The Fc-coverage, estimated by time-of-flight secondary-ion mass spectrometry (TOF-SIMS) and cyclic voltammetry (CV), suggested validity of Fc-ATP conjugates as kinase co-substrates. Depending on the length of the alkyl spacer of the Fc-ATP conjugate, different current densities were obtained, pointing to a direct correlation between the two. Molecular modeling revealed that the structural constraint imposed by the short alkyl spacer (1 a) causes a steric congestion and negatively affects the outcome of phosphorylation reaction. An optimal analytical response was obtained with the Fc-ATP conjugates with linker lengths longer than six CH(2) groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,422

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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