Association of a risk allele of <i>ANK3</i> with cognitive performance and cortical thickness in patients with first-episode psychosis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The gene ANK3 is implicated in bipolar disorder and schizophrenia. The present study investigated the influence of this gene on cognitive performance and brain structure among individuals with first-episode psychosis (FEP). The brief illness duration of an FEP sample makes it well suited for studying the effects of genetic variation. METHODS: We genotyped 2 single nucleotide polymorphisms (SNPs; rs1938526 and rs10994336) in ANK3 in patients with FEP. Multivariate analysis of variance compared risk allele carriers and noncarriers on 6 domains of cognition consistent with MATRICS consensus. A subsample of 82 patients was assessed using magnetic resonance imaging. We compared brain structure between carriers and noncarriers using cortical thickness analysis and voxel-based morphometry on white matter. RESULTS: In the 173 patients with FEP included in our study, rs1938526 and rs10994336 were in very high linkage disequilibrium (d' = 0.95), and analyses were therefore only carried out on the SNP (rs1938526) with the highest minor allele frequency (G). Allele G of rs1938526, was associated with lower cognitive performance across domains (F6,164 = 2.38, p = 0.030) and significantly lower scores on the domains of verbal memory (p = 0.015), working memory (p = 0.006) and attention (p = 0.019). The significant effects of this SNP on cognition were not maintained when controlling for IQ. Cortical thinning was observed in risk allele carriers at diverse sites across cortical lobes bilaterally at a threshold of p < 0.01, false discovery rate-corrected. Risk-allele carriers did not show any regions of reduced white matter volume. LIMITATIONS: The sample size is modest given that a low-frequency variant was being examined. CONCLUSION: The ANK3 risk allele rs1938526 appears to be associated with general cognitive impairment and widespread cortical thinning in patients with FEP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».