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Enregistrement W2147686473 · doi:10.1128/jcm.01858-08

Multiplexed Real-Time PCR Assay for Discrimination of <i>Plasmodium</i> Species with Improved Sensitivity for Mixed Infections

2009· article· en· W2147686473 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensProvincial Laboratory of Public HealthUniversity of AlbertaMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Research Council of the PhilippinesUniversity of AlbertaPublic Health Agency of CanadaMcGill University
Mots-clésBiologyPlasmodium falciparumGold standard (test)MultiplexMalariaPolymerase chain reactionPrimer (cosmetics)Multiplex polymerase chain reactionVirologyParasitologyPlasmodium (life cycle)Assay sensitivitySpecies identificationMicrobiologyImmunologyParasite hostingGeneticsMedicinePathologyChemistryZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The implementation of real-time PCR for the diagnosis of malaria has been hampered by poor sensitivity for the detection of mixed infections. We have optimized a method that enhances the sensitivity of detection of minor species in mixed infections within a single multiplex reaction. Our assay uses species-specific forward primers in combination with a conserved reverse primer and largely overcomes primer competition for the minor species DNA. With a blind panel of clinical samples, we successfully identified the species in 13/16 mixed infections. This assay was further validated with 91 blood samples and demonstrated a specificity and sensitivity for single infections of 100% compared with nested PCR as the "gold standard." This test has been implemented for routine confirmation of malaria species in Alberta, Canada. In comparison with species identification by microscopy, the real-time PCR test demonstrated greater sensitivity for the identification of species causing low-level and mixed infections and for the discrimination of Plasmodium species other than Plasmodium falciparum. Our experience supports a role for real-time PCR in the identification of malarial species in conjunction with microscopy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,649
Score d'incertitude au seuil0,637

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle