Pneumococcal surface protein A (PspA) family distribution among clinical isolates from adults over 50 years of age collected in seven countries
Notice bibliographique
Résumé
The pneumococcal surface protein PspA, a cell-wall-associated surface protein, is a promising component for pneumococcal vaccines. In this study, the distribution of the PspA family was determined in a panel of invasive and clinically important pneumococcal isolates from adults over 50 years of age, collected between 1995 and 2002. One thousand eight hundred and forty-seven recent isolates from invasive pneumococcal disease were obtained from seven Western countries, together with clinical data. An ELISA-based serological method was standardized in order to determine the PspA family and clade distribution. Molecular tests were used when isolates were non-typable by ELISA (PspA family typing by PCR). Only 42 (2.3 %) isolates were non-typable by ELISA and PspA family typing by PCR was performed. Finally, 3 isolates were considered as non-pneumococcal and 1844 were classified as follows: 749 (40.6 %) were PspA family 1, 1078 (58.5 %) were PspA family 2, 13 (0.7 %) were PspA family 1 and 2 and 4 (0.2 %) remained non-typable. The cross-reactivity of antibodies to PspAs of different clades was confirmed. In conclusion, inclusion of PspA family 1 and family 2 in future pneumococcal vaccines would ensure broad coverage of pneumococcal strains infecting people over 50 years of age.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».