SOX11 expression is highly specific for mantle cell lymphoma and identifies the cyclin D1-negative subtype
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Cyclin D1-negative mantle cell lymphoma is difficult to distinguish from other small B-cell lymphomas. The clinical and pathological characteristics of patients with this form of lymphoma have not been well defined. Overexpression of the transcription factor SOX11 has been observed in conventional mantle cell lymphoma. The aim of this study was to determine whether this gene is expressed in cyclin D1-negative mantle cell lymphoma and whether its detection may be useful to identify these tumors. DESIGN AND METHODS: The microarray database of 238 mature B-cell neoplasms was re-examined. SOX11 protein expression was investigated immunohistochemically in 12 cases of cyclin D1-negative mantle cell lymphoma, 54 cases of conventional mantle cell lymphoma, and 209 additional lymphoid neoplasms. RESULTS: SOX11 mRNA was highly expressed in conventional and cyclin D1-negative mantle cell lymphoma and in 33% of the cases of Burkitt's lymphoma but not in any other mature lymphoid neoplasm. SOX11 nuclear protein was detected in 50 cases (93%) of conventional mantle cell lymphoma and also in the 12 cyclin D1-negative cases of mantle cell lymphoma, the six cases of lymphoblastic lymphomas, in two of eight cases of Burkitt's lymphoma, and in two of three T-prolymphocytic leukemias but was negative in the remaining lymphoid neoplasms. Cyclin D2 and D3 mRNA levels were significantly higher in cyclin D1-negative mantle cell lymphoma than in conventional mantle cell lymphoma but the protein expression was not discriminative. The clinico-pathological features and outcomes of the patients with cyclin D1-negative mantle cell lymphoma identified by SOX11 expression were similar to those of patients with conventional mantle cell lymphoma. CONCLUSIONS: SOX11 mRNA and nuclear protein expression is a highly specific marker for both cyclin D1-positive and negative mantle cell lymphoma.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».