MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2147804517 · doi:10.1094/pdis-05-14-0507-pdn

First Report of Cabbage Head Rot Caused by <i>Fusarium avenaceum</i> in Poland

2014· article· en· W2147804517 sur OpenAlexaboutno aff
J. Robak, Anna Czubatka, Agnieszka Czajka, U. Smolińska

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConidiumBiologyMyceliumPotato dextrose agarChlamydosporeCapitataOrange (colour)HorticultureInoculationBotanyBrassica oleraceaAgarFusariumGerm tube

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cabbage (Brassica oleracea L. var. capitata L.) is an important crop in Poland. Symptoms of a disease affecting cabbage were observed in 2012 and 2013 both in mid-August during the growing season and during storage in January and February. The disease affected about 30 to 40% of crops grown on ~9,000 ha over three locations: Charsznica in south Poland and Bedlno and Skierniewice in central Poland. Circular, watery lesions ranging from 10 to 60 mm in diameter on the surface of affected cabbage heads included whitish aerial mycelium that developed orange sporodochia in the center of each lesion. After 2 to 3 weeks, infection covered each entire cabbage head. A fungal pathogen was isolated from the orange lesions and from infected internal tissue. After sterilization of the excised tissue in 70% ethanol, the sections were each rinsed twice with sterilized water, dried on sterilized filter paper, and plated onto potato dextrose agar (PDA). Isolations consistently yielded morphologically homogeneous fungal colonies with abundant aerial mycelium that ranged from yellow to brownish yellow. The fungus produced pigmentation that changed the agar medium from dark yellow to brownish-burgundy. The mean colony growth was 66 mm after 7 days at 25°C. The fungus formed macroconidia, but microconidia and chlamydospores were not observed. Macroconidia were slender, slightly falcate, usually 3- to 5-septate, 44.7 to 60.7 × 3.7 to 5.5 μm, and formed in abundant orange sporodochia. On PDA, the isolates lost the ability to form sporodochia. Morphological and cultural features were typical of those of F. avenaceum (Fries) Saccardo (2). Koch's postulates were conducted to establish pathogenicity of each of four of the isolates on cabbage heads of the cv. Jaguar F1 (Bejo Seeds, Poland). The outer leaf of each head was inoculated with an 8-mm-diameter PDA plug colonized by the appropriate isolate (four cabbage heads/isolate), and the heads stored in a growth chamber at 25°C. After 5 to 7 days, lesions similar to those observed on naturally infested cabbage were observed on all the inoculated cabbage leaves. Four cabbage heads treated similarly with water as a control treatment remained symptomless. The experiment was repeated. DNA extracted from two of the four isolates was subjected to a PCR assay with primers ITS5 and ITS4 (4) for species identification based on the ITS1 and ITS2 sequences of ribosomal DNA (rDNA). The two sequences differed by 1 bp in the ITS2 region and had 100% identity with ITS sequences of F. avenaceum Accession Nos. AY147283 and AY147285 in GenBank. The sequences were deposited in GenBank as KM189440 and KM189441. Descriptions of fusarium head rot of cabbage in the United States (1) and Canada (3) were consistent with these observations in Poland. To our knowledge, this is the first report of F. avenaceum causing head rot of cabbage in Poland and in Europe. References: (1) H. R. Dillard and A. C. Cobb. Phytopathology 96:30. 2006. (2) J. F. Leslie and B. A. Summerell. Page 132 in: The Fusarium Laboratory Manual, Blackwell Publishing, Hoboken, NJ, 2006. (3) R. D. Peters et al. HortSci. 42:737. 2007. (4) T. J. White et al. Page 315 in: PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications. Academic Press, San Diego, 1990.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePlant DiseaseMême sujetPlant Pathogens and Fungal DiseasesTravaux en français237 207