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Enregistrement W2147865160 · doi:10.3390/v6114760

Nomenclature- and Database-Compatible Names for the Two Ebola Virus Variants that Emerged in Guinea and the Democratic Republic of the Congo in 2014

2014· article· en· W2147865160 sur OpenAlexaff
Jens H. Kuhn, Kristian G. Andersen, Sylvain Baize, Yīmíng Bào, Sina Bavari, Nicolás Berthet, Olga Blinkova, J. Rodney Brister, Anna N. Clawson, Joseph N. Fair, Martin Gabriel, Robert F. Garry, Stephen Gire, Augustine Goba, Jean‐Paul Gonzalez, Stephan Günther, Christian Happi, Peter B. Jahrling, Jimmy Kapetshi, Gary Kobinger, Jeffrey R. Kugelman, Eric M. Leroy, Gaël Darren Maganga, Placide Mbala, Lina Moses, Jean‐Jacques Muyembé‐Tamfum, Magassouba N’Faly, Stuart T. Nichol, Sunday Omilabu, Gustavo Palacios, Daniel J. Park, Janusz T. Pawęska, Sheli R. Radoshitzky, Cynthia A. Rossi, Pardis C. Sabeti, John S. Schieffelin, Randal J. Schoepp, Rachel Sealfon, Robert Swanepoel, Jonathan S. Towner, Jiro Wada, Nadia Wauquier, Nathan L. Yozwiak, Pierre Formenty

Notice bibliographique

RevueViruses · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthDepartment of Health and Human Services, State Government of Victoria
Mots-clésEbola virusVirologyNomenclatureDemocracyBiologyGeographyPolitical scienceVirusZoologyLawPoliticsTaxonomy (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In 2014, Ebola virus (EBOV) was identified as the etiological agent of a large and still expanding outbreak of Ebola virus disease (EVD) in West Africa and a much more confined EVD outbreak in Middle Africa. Epidemiological and evolutionary analyses confirmed that all cases of both outbreaks are connected to a single introduction each of EBOV into human populations and that both outbreaks are not directly connected. Coding-complete genomic sequence analyses of isolates revealed that the two outbreaks were caused by two novel EBOV variants, and initial clinical observations suggest that neither of them should be considered strains. Here we present consensus decisions on naming for both variants (West Africa: "Makona", Middle Africa: "Lomela") and provide database-compatible full, shortened, and abbreviated names that are in line with recently established filovirus sub-species nomenclatures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,044

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0070,007
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations94
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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