Engineering of a thioglycoligase: randomized mutagenesis of the acid-base residue leads to the identification of improved catalysts
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Thioglycoligases are recently introduced variants of retaining glycosidases in which the acid-base catalyst has been mutated, rendering them capable of thioglycoside synthesis. The original acid-base mutant of Agrobacterium sp. beta-glucosidase (E170A) was previously shown to be an effective thioglycoligase carrying out glycosyltransfer from 2,4-dinitrophenyl glycosides to several different thio sugar acceptors. Here we report the generation of a screen for improved thioglycoligases, randomized mutagenesis of the acid-base catalyst E170 and identification of variants superior to E170A. Furthermore we have established a coupled assay allowing kinetic analysis of isolated variants and found that Abg E170Q is 5-fold faster than Abg E170A when 2,4-dinitrophenyl glucoside is used as donor and 100-fold faster when glucosyl azide is used. To demonstrate its utility, different acceptor and donor sugar combinations were employed to produce thio-linked di- or trisaccharides in high yields, showing the considerable versatility of the system for the synthesis of carbohydrate mimetics.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle