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Enregistrement W2148022809 · doi:10.1002/gepi.20350

Multipoint lods provide reliable linkage evidence despite unknown limiting distribution: type I error probabilities decrease with sample size for multipoint lods and mods

2008· article· en· W2148022809 sur OpenAlex
Susan E. Hodge, Laura Rodriguez‐Murillo, Lisa J. Strug, David A. Greenberg

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenetic Epidemiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Human Genome Research InstituteNational Institute of Mental Health
Mots-clésType I and type II errorsLinkage (software)Sample size determinationStatisticsMathematicsLimitingRange (aeronautics)Position (finance)Zero (linguistics)Sample (material)GeneticsBiologyPhysicsThermodynamics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We investigate the behavior of type I error rates in model-based multipoint (MP) linkage analysis, as a function of sample size (N). We consider both MP lods (i.e., MP linkage analysis that uses the correct genetic model) and MP mods (maximizing MP lods over 18 dominant and recessive models). Following Xing and Elston (2006 Genet. Epidemiol, 30: 447-458), we first consider MP linkage analysis limited to a single position; then we enlarge the scope and maximize the lods and mods over a span of positions. In all situations we examined, type I error rates decrease with increasing sample size, apparently approaching zero. We show: (a) For MP lods analyzed only at a single position, well-known statistical theory predicts that type I error rates approach zero. (b) For MP lods and mods maximized over position, this result has a different explanation, related to the fact that one maximizes the scores over only a finite portion of the parameter range. The implications of these findings may be far-reaching: Although it is widely accepted that fixed nominal critical values for MP lods and mods are not known, this study shows that whatever the nominal error rates are, the actual error rates appear to decrease with increasing sample size. Moreover, the actual (observed) type I error rate may be quite small for any given study. We conclude that MP lod and mod scores provide reliable linkage evidence for complex diseases, despite the unknown limiting distributions of these MP scores.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,049
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,197
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,049
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle