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Enregistrement W2148085256 · doi:10.3899/jrheum.120814

HLA-G 3′ Untranslated Region Polymorphisms Are Associated with Systemic Lupus Erythematosus in 2 Brazilian Populations

2013· article· en· W2148085256 sur OpenAlexvenueno aff
Norma Lucena‐Silva, Veridiana Sales Barbosa de Souza, Renan Garcia Gomes, Alex Fantinatti, Yara Costa Netto Muniz, Rafael Sales de Albuquerque, Alessandra Luna Ramos Monteiro, George Tadeu Nunes Diniz, Maria Rosângela Cunha Duarte Coêlho, Celso Teixeira Mendes‐Junior, Erick C. Castelli, Eduardo Antônio Donadi

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive System and Pregnancy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundação Oswaldo CruzFundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de PernambucoConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Mots-clésHaplotypeAlleleGenotypeThree prime untranslated regionUntranslated regionHuman leukocyte antigenLupus erythematosusGeneticsImmunologyMedicineBiologyGeneMessenger RNAAntigenAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: HLA-G has well recognized tolerogenic properties in physiological and nonphysiological conditions. The 3' untranslated region (3'UTR) of the HLA-G gene has at least 3 polymorphic sites (14-bpINS/DEL, +3142C/G, and +3196C/G) described as associated with posttranscriptional influence on messenger RNA production; however, only the 14-bpINS/DEL and +3142C/G sites have been studied in systemic lupus erythematosus (SLE). METHODS: We investigated the HLA-G 3'UTR polymorphic sites (14-bpINS/DEL, +3003C/T, +3010C/G, +3027A/C, +3035C/T, +3142C/G, +3187A/G, and +3196C/G) in 190 Brazilian patients with SLE and 282 healthy individuals in allele, genotype, and haplotype analyses. A multiple logistic regression model was used to assess the association of the disease features with the HLA-G 3'UTR haplotypes. RESULTS: Increased frequencies were observed of the 14-bpINS (p = 0.053), +3010C (p = 0.008), +3142G (p = 0.006), and +3187A (p = 0.013) alleles, and increased frequencies of the 14-bpINS-INS (p = 0.094), +3010 C-C (p = 0.033), +3142 G-G (p = 0.021), and +3187 A-A (p = 0.035) genotypes. After Bonferroni correction, only the +3142G (p = 0.05) and +3010C (p = 0.06) alleles were overrepresented in SLE patients. The UTR-1 haplotype (14-bpDEL/+3003T/+3010G/+3027C/+3035C/+3142C/+3187G/+3196C) was underrepresented in SLE (pcorr = 0.035). CONCLUSION: These results indicate that HLA-G 3'UTR polymorphic sites, particularly +3142G and +3010C alleles, were associated with SLE susceptibility, whereas UTR-1 was associated with protection against development of SLE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,402
Score d'incertitude au seuil0,462

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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