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Enregistrement W2148266943 · doi:10.1603/033.046.0332

Surveillance of Mosquito-Borne Viruses in Alberta Using Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction With Generic Primers

2009· article· en· W2148266943 sur OpenAlexaffabout
Kanti Pabbaraju, Kevin Ho, Sallene Wong, Julie D. Fox, Brynn Kaplen, Shaun Tyler, Michael Drebot, Peter Tilley

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Entomology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensChildren's & Women's Health Centre of British ColumbiaUniversity of CalgaryProvincial Laboratory of Public Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBunyaviridaeVirologyArbovirusOrthobunyavirusFlavivirusFlaviviridaePolymerase chain reactionTogaviridaeVirusAlphavirusTaqManViral diseaseGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mosquitoes collected during 2003, 2004, and 2005 in Alberta, Canada, were screened for the presence of a wide range of arboviruses by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Nucleic acid extracts from mosquito slurries were amplified using universal primers designed to detect viruses belonging to the Flavivirus genus of the Flaviviridae family and California and Bunyamwera serogroups of the Bunyavirus genus within the Bunyaviridae family. Species-specific detection of Western equine encephalitis virus and Eastern equine encephalitis virus was also performed. Amplified products were analyzed, and the viral target was identified by sequencing. Of the 418 pools tested, 3 pools contained Cache Valley virus belonging to Bunyaviridae and 103 pools were positive for a previously undescribed flaviviral sequence that was most similar to Kamiti River virus. These data suggest that nucleic acid amplification using broadly reactive primers can be adopted for arbovirus surveillance in mosquito populations, and this approach has the potential to detect both previously recognized and novel viruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,781
Score d'incertitude au seuil0,433

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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