MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2148403797 · doi:10.1128/iai.71.5.2525-2533.2003

Identification of a<i>Treponema pallidum</i>Laminin-Binding Protein

2003· article· en· W2148403797 sur OpenAlexfundno aff
Caroline E. Cameron

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSyphilis Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthUniversity of Washington
Mots-clésLamininBiologyBacterial adhesinExtracellular matrixTreponemaBasement membraneMicrobiologyCell biologyMolecular biologyVirulenceBiochemistryVirologyGeneSyphilis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Host extracellular matrix (ECM) components represent ideal microbial adhesion targets that many pathogens use for colonization of tissues and initiation of infection. This study investigated the interaction of the spirochete Treponema pallidum with the ECM component laminin. To identify candidate laminin-binding adhesins, the T. pallidum genome was analyzed to predict open reading frames that encode putative outer membrane proteins, as these proteins interact directly with host ECM components. Subsequent recombinant expression of these proteins and analysis of their laminin-binding potential identified one protein, Tp0751, that demonstrated specific attachment to laminin. Tp0751 attached to laminin in a dose-dependent, saturable manner but did not attach to the ECM component collagen type I or IV or to the negative control proteins fetuin or bovine serum albumin. Sodium metaperiodate treatment of laminin reduced the Tp0751-laminin interaction in a concentration-dependent manner, suggesting that oligosaccharides play a role in this interaction. In addition, Tp0751-specific antibodies were detected in serum samples collected from both experimental and natural syphilis infections, indicating that Tp0751 is expressed in vivo during the course of infection. Collectively, these experiments identified Tp0751 as a laminin-binding protein that is expressed during infection and may be involved in attachment of T. pallidum to host tissues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations87
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInfection and ImmunityMême sujetSyphilis Diagnosis and TreatmentTravaux en français237 207