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Enregistrement W2148428968 · doi:10.2215/cjn.02690806

Recessive NPHS2 (Podocin) Mutations Are Rare in Adult-Onset Idiopathic Focal Segmental Glomerulosclerosis

2006· article· en· W2148428968 sur OpenAlexafffund
Ning He, Alireza Zahirieh, Yan Mei, Brian Lee, Sean Senthilnathan, Betty Wong, Bettina E. Mucha, Friedhelm Hildebrandt, David E.C. Cole, Daniel C. Cattran, York Pei

Notice bibliographique

RevueClinical Journal of the American Society of Nephrology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensToronto General HospitalSunnybrook Health Science CentreUniversity of TorontoWomen's College HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesKidney Foundation of CanadaAmerican Society of Nephrology
Mots-clésPodocinMedicineFocal segmental glomerulosclerosisMinimal change diseaseCompound heterozygosityMissense mutationPopulationMutationInternal medicinePathologyGeneticsGlomerulonephritisBiologyGeneProteinuriaPodocyteKidney

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recessive NPHS2 (podocin) mutations account for up to approximately 30% of steroid-resistant idiopathic FSGS in children and are associated with a reduced risk for disease recurrence after renal transplantation. R229Q, a missense variant that is present in 3.6% of the white population, has been implicated as a common disease-causing mutation. Given these clinical implications, we examined the role of NPHS2 mutations in a cohort of patients with adult-onset FSGS. We used denaturing HPLC to screen for heterozygous and homozygous gene variants in PCR-amplified DNA fragments that contained all exons and splice junctions of NPHS2. Bidirectional sequencing was performed to define all of the gene variants detected. With the use of the denaturing HPLC in a single-blind pilot study, 40 of 43 known NPHS2 mutations were detected from 22 pediatric patients with FSGS to establish a test sensitivity of 93%. This screen then was applied to 87 adult patients with idiopathic FSGS (15 steroid-sensitive, 63 steroid-resistant, and nine familial cases). In this latter cohort, compound heterozygous mutations were detected only in one patient with steroid-sensitive FSGS (R229Q and Q285fsX302) and no homozygous mutations. Overall, R229Q accounted for eight (80%) of ten of the putative mutant alleles that were detected in the study cohort. Contrary to the pediatric experience, recessive NPHS2 mutations are rare in this study population, suggesting that the pathogenesis of FSGS in adults may differ from that in children. These data do not support R229Q as a disease-causing mutation for steroid-resistant FSGS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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