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Enregistrement W2148513430 · doi:10.17221/6616-cjas

Genetic variation at RYR1, IGF2, FUT1, MUC13, and KPL2 mutations affecting production traits in Chinese commercial pig breeds

2013· article· en· W2148513430 sur OpenAlexaboutno aff
Guang‐Ping Ruan, Yucheng Xing, Yinglun Fan, Ruimin Qiao, Xue-Lian He, B. Yang, Nengshui Ding, Jun Ren, Lusheng Huang, Shijun Xiao

Notice bibliographique

RevueCzech Journal of Animal Science · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneticsAlleleLocus (genetics)RYR1Linkage disequilibriumWhite (mutation)Large whitePig breedingMarker-assisted selectionAllele frequencyGenotypeGeneHaplotypeAnimal science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The identification of causative mutations affecting economically important traits has benefited the worldwide pig industry. We investigated the genetic variation at five loci including RYR1, IGF2, FUT1, MUC13, and KPL2 affecting traits related to production, reproduction, and disease resistance in a sample of 8009 pigs representing 3 commercial breeds (Duroc, Landrace, and Large White) from 28 farms in China. We found that all breeds, especially Duroc pigs, have high frequencies of favourable alleles for lean production and stress resistance at the IGF2 and RYR1 loci. However, all breeds have low frequencies of the diarrhea-resistant allele of FUT1, indicating that multigenerational selection is required for E. coli F18+ resistant pigs. No linkage disequilibrium was found between the RYR1 and FUT1 loci on pig chromosome 6, supporting the possibility of combined selection for both F18 and stress-resistant pigs. Relatively high frequencies (> 0.5) of the MUC13 allele conferring resistance to E. coli F4ac were found in all three breeds with the highest frequency in Duroc pigs, suggesting that the breeders can establish F4ac diarrhea-resistant lines in a few generations. No defective allele at the KPL2 locus causing immotile short-tail sperms was found in Large White pigs of American, Canadian, Danish, English, and French origin, supporting the conclusion that the KPL2 defective allele is present exclusively in Finnish Large White pigs. These results provide useful information for pig breeding schemes in China.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,942
Score d'incertitude au seuil0,301

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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