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Enregistrement W2148527492 · doi:10.1073/pnas.0307694100

Analysis of <i>Pseudomonas aeruginosa</i> 4-hydroxy-2-alkylquinolines (HAQs) reveals a role for 4-hydroxy-2-heptylquinoline in cell-to-cell communication

2004· article· en· W2148527492 sur OpenAlexaff
Éric Déziel, François Lépine, Sylvain Milot, Jianxin He, Michael Mindrinos, Ronald G. Tompkins, Laurence G. Rahme

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésQuorum sensingPseudomonas aeruginosaOperonCell signalingBiologyAutoinducerBiochemistryPopulationVirulenceGeneHomoserineBacteriaBiosynthesisSignal transductionMicrobiologyChemistryGeneticsEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacterial communities use "quorum sensing" (QS) to coordinate their population behavior through the action of extracellular signal molecules, such as the N-acyl-l-homoserine lactones (AHLs). The versatile and ubiquitous opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa is a well-studied model for AHL-mediated QS. This species also produces an intercellular signal distinct from AHLs, 3,4-dihydroxy-2-heptylquinoline (PQS), which belongs to a family of poorly characterized 4-hydroxy-2-alkylquinolines (HAQs) previously identified for their antimicrobial activity. Here we use liquid chromatography (LC)/MS, genetics, and whole-genome expression to investigate the structure, biosynthesis, regulation, and activity of HAQs. We show that the pqsA-E operon encodes enzymes that catalyze the biosynthesis of five distinct classes of HAQs, and establish the sequence of synthesis of these compounds, which include potent cytochrome inhibitors and antibiotics active against human commensal and pathogenic bacteria. We find that anthranilic acid, the product of the PhnAB synthase, is the primary precursor of HAQs and that the HAQ congener 4-hydroxy-2-heptylquinoline (HHQ) is the direct precursor of the PQS signaling molecule. Significantly, whereas phnAB and pqsA-E are positively regulated by the virulence-associated transcription factor MvfR, which is also required for the expression of several QS-regulated genes, the conversion of HHQ to PQS is instead controlled by LasR. Finally, our results reveal that HHQ is itself both released from, and taken up by, bacterial cells where it is converted into PQS, suggesting that it functions as a messenger molecule in a cell-to-cell communication pathway. HAQ signaling represents a potential target for the pharmacological intervention of P. aeruginosa-mediated infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations648
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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