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Enregistrement W2148596215 · doi:10.1128/iai.01320-07

Comparison of the Effects of<i>Leishmania major</i>or<i>Leishmania donovani</i>Infection on Macrophage Gene Expression

2007· article· en· W2148596215 sur OpenAlexafffund
David J. Gregory, Robert Sladek, Martin Olivier, Greg Matlashewski

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensMcGill University and Génome Québec Innovation CentreMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésLeishmania donovaniBiologyLeishmaniaLeishmania majorGene expressionMacrophageGeneMicrobiologyLeishmaniasisImmunologyMolecular biologyVisceral leishmaniasisParasite hostingGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The intracellular parasite Leishmania causes a wide spectrum of human disease, ranging from self-resolving cutaneous lesions to fatal visceral disease, depending on the species of Leishmania involved. The mechanisms by which different Leishmania species cause different pathologies are largely unknown. We have addressed this question by comparing the gene expression profiles of bone marrow-derived macrophages infected with either Leishmania donovani or L. major promastigotes. We found that the two species had very similar effects on macrophage gene expression. Both species caused a small (<2.5-fold) but statistically significant repression of several hundred genes. In addition, both species strongly induced and repressed about 60 genes. Comparing the effects of the two species showed that only 26 genes were regulated differently by L. major as opposed to L. donovani, including those for metallothioneins 1 and 2, HSP70 and -72, CCL4, Gadd45beta, Dsp1, matrix metalloprotease 13, T-cell death-associated gene 51 (Tdag51), RhoB, spermine/spermidine N1-acyl transferase 1 (SSAT), and Cox2. L. donovani-infected macrophages were also found to express higher levels of Cox2 protein and prostaglandin E synthase mRNA than L. major-infected macrophages. While both species have previously been shown to trigger prostaglandin E synthesis by bystander cells, this study suggests that infected macrophages themselves express prostaglandin E-synthesizing genes only in response to L. donovani.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,090
Score d'incertitude au seuil0,660

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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